Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms