Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms