Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q5VSD8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms