Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms