Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A3Q5K4L6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms