Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 BCL11A-204ENST00000359629 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC006064.1-201ENST00000499202 560 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C4orf48Q5BLP8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms