Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDCCQ504Y2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms