Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms