Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms