Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms