Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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