Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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