Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
FSCN1Q16658 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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