Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms