Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDB1Q16531 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
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