Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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E2F4Q16254 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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E2F4Q16254 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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E2F4Q16254 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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E2F4Q16254 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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E2F4Q16254 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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