Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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