Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDCD1Q15116 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDCD1Q15116 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDCD1Q15116 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDCD1Q15116 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDCD1Q15116 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PDCD1Q15116 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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