Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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