Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GAPVD1Q14C86 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GAPVD1Q14C86 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
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