Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms