Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RFTN1Q14699 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RFTN1Q14699 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RFTN1Q14699 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RFTN1Q14699 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RFTN1Q14699 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RFTN1Q14699 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RFTN1Q14699 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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