Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC3Q14574 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms