Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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