Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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