Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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