Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCIRG1Q13488 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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