Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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