Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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