Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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