Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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