Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms