Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms