Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLEQ07864 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms