Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms