Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms