Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms