Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms