Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms