Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM3Q01628 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms