Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms