Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms