Protein–RNA interactions for Protein: P63272

SUPT4H1, Transcription elongation factor SPT4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT4H1P63272 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUPT4H1P63272 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms