Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UFM1P61960 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms