Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VBP1P61758 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms