Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCDC1P59894 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms