Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms