Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A5P58743 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms