Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms