Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms